L’initiative française constitue également un moyen de mettre en œuvre un processus innovateur en terme de gestion et d'organisation de programme de coopération européenne. Pour être efficace, la gestion d'un programme de coopération doit se faire à travers un point unique de décision et un point unique d'exécution.

C'est pour cette raison que le programme de démonstrateur technologique nEUROn a été organisé de la manière suivante :

• une agence d'exécution unique, la DGA française, attribue un contrat principal au maître d'œuvre et gère le projet ;
• un maître d'œuvre unique, Dassault Aviation, est responsable de l'exécution du contrat principal.

Dès le début de ce programme, les autorités françaises ont voulu inscrire le projet de démonstrateur technologique nEUROn dans la dynamique de l’Europe de la défense en l’ouvrant complètement à la coopération. C’est pourquoi environ la moitié de la charge de travail est confiée à des partenaires industriels non français.

En termes de gestion, cette organisation est la garantie d'une efficacité optimale et d’une meilleure maîtrise des coûts, dans le cadre d'un partenariat et d'une coopération pragmatiques entre les différents acteurs.

Pour arriver à cet objectif, la DGA française, en tant qu'agence exécutive, a mené des négociations avec les représentants des différents gouvernements européens afin de finaliser les termes et conditions de leur participation à ce projet. Parallèlement, Dassault Aviation, en tant que maître d'œuvre, a constitué une équipe de coopérants européens. Cette organisation novatrice devrait permettre de se conformer de manière stricte aux besoins du projet, en termes de performances, de budget et de planning.